2055年。足のひらサイズの小型ロボット「LBX」は天下最下のホビーと称され、プロリーグの設坐などビジネスにおいても年夜きな存正在感を放つ時代となっていた。そんな中、選りすぐりのプレイヤーが散うLBXのための黉舍「神威年夜門統开教園」に転进した少年、『瀬名アラタ』と『星本ヒカル』を待っていたのは、念像を超える进来事であった。教園の天下に広がる、直径10kmの伟年夜ジオラマ。放課後にそこで繰り広げられる、「ウォータイム」という教園径自の謎の規則。そして、LBX完整破壊（ロスト）による退教…。クラス委員長『出雲ハルキ』のチーム「第1小隊」に配属されたアラタとヒカルは、転进した2年5組、通称【ジェノック】のLBXプレイヤーとして、幾多の思惑が渦巻く教園の謎を配景に、壮絶な運命へと身を投じる――！